论文查重入口的隐私保护措施包括但不限于：1.数据加密传输：通过SSL等加密协议确保用户上传的论文和个人信息在传输过程中不被窃取；2.匿名查重：用户上传的论文在查重过程中使用匿名标识，避免泄露作者身份；3.信息保密：平台严格保密用户上传的论文内容，不会用于其他商业用途或泄露给第三方。

为了更好地保障用户隐私安全，论文查重入口还应采取进一步的措施：1.隐私协议明确：用户在使用服务前需明确同意隐私政策，了解平台对用户信息的收集和使用方式；2.安全审计机制：定期对平台的隐私保护措施进行安全审计，及时发现和解决潜在风险；3.用户权限管理：用户可以自主选择公开或保密论文查重结果，保护用户隐私权益。